L’enseignement secondaire a lui aussi ses filières en alternance. Deux possibilités s’offrent aux jeunes et aux entreprises. Les CEFA et l’IFAPME Les CEFA (centre d’éducation et de formation en alternance) propose plusieurs métiers : technicien en productique, métallier-soudeur, chaudronnier,… L’IFAPME qui est aussi un opérateur de l’alternance a également quelques formations dans le secteur technologique. Il existe aussi l’immersion, qui est un stage de plus longue durée dans l’enseignement qualifiant.
L’extension de l’alternance écoles-entreprises a été largement prônée par les acteurs du pacte pour un enseignement d’excellence. Des projets pilotes d’immersion (une formule intermédiaire entre les stages et l’enseignement en alternance stricto sensu) sont en cours pour les métiers suivants : technicien en système d’usinage, électricien-automaticien, soudeur, …